為了改善巴金森病的症狀，甚至積極地從根本治療，多年來全球醫學界紛紛從巴金森病的病理著眼，循跡找尋可能有所突破的環節，目前發展出三大治療方向，包括：從最源頭著手的幹細胞移植、神經保護治療；以藥物彌補不足的多巴胺；以及透過外科手術改變大腦生理迴路的深腦刺激術或燒灼術。 這三大方向包含以下幾種療法：

1. 藥物治療：這是目前運用最廣的第一線療法。由於巴病患者的症狀導因於腦中多巴胺分泌不足，因此以服用多巴胺藥物的方式調節大腦的生化作用，使腦中多巴胺含量盡可能恢復到正常狀態，以獲得症狀的改善。

2. 燒灼術：燒灼術可以說是深腦刺激術的前驅，其作法是透過外科手術，以燒灼的方式將過度活躍而導致肢體行動不協調的神經細胞破壞掉，以改善症狀。此 療法的發現，乃因為醫師們無意中發現，巴金森患者中風後，其巴金森的症狀居然消失了；因此便發展出這種以燒灼的方式在腦中模擬類似中風狀況，以改善巴金森症狀之療法。雖然其後拜影像醫學發達所賜，以立體定位手術將探針深入腦內燒灼，治療位置更為精確；然而，這畢竟是以破壞某些正常腦組織為代價的療法，終究無法受到醫界及患者的普遍認同。

3. 深腦刺激術：燒灼術發展到後期，轉而以電刺激替代燒灼破壞，以調控大腦迴路的運作，甚至將電刺激器安裝在蒼白球、視丘下核（subthalamicnucleus）等 處以方便進行電刺激，最後漸漸演變成現在的深腦刺激術，為目前巴金森病最主要的外科手術療法。

4. 神經保護治療：著眼於保護神經細胞，避免其繼續退化。到目前為止，科學家仍在尋找可行的方法。

5. 幹細胞治療：以幹細胞移植的方式彌補黑質部因退化而減少的細胞，恢復多巴胺的「產能」。目前仍在研究階段。